공생의 생태와 진화
식물 뿌리의 균근균, 지의류를 이루는 균과 광합성생물, 절지동물의 몸과 양식수에 사는 미생물을 연구 대상으로 합니다.
여기에서 말하는 공생은 서로 이익을 주고받는 관계로 한정되지 않습니다. 한쪽만 이익을 얻는 관계와 숙주에 해를 끼치는 관계까지 포함합니다.
QUESTIONS
공생생물의 다양성과 분류
야외에서 시료를 채집하고 미생물을 분리·배양합니다. 형태와 분자계통 정보로 새로운 종을 기재하고 계통을 정리하며, 유전체를 해독합니다. 분석에 쓰는 서열 자료가 정확한지 검토하는 일도 여기에 속합니다.
공생 상호작용의 기능과 생태적 맥락
숙주와 미생물이 서로에게 미치는 영향을 배양 실험과 군집 분석으로 확인합니다. 같은 관계라도 기후와 계절, 서식지에 따라 달라지기 때문에 조건에 따른 변화를 함께 봅니다.
공생의 기원과 진화
계통과 유전체, 집단유전 자료를 이용해 공생생물이 분화하고 확산해 온 과정을 추적합니다. 공생에 관여하는 형질이 언제 나타났고 계통마다 어떻게 바뀌었는지를 봅니다.
SUBJECTS
하나의 숙주나 생물군에 연구 대상을 한정하지 않습니다. 계통적으로 멀리 떨어진 숙주를 함께 다루면, 숙주에 따라 달라지는 것과 공생계 전반에 공통된 것을 나누어 볼 수 있습니다.
METHODS
연구는 대개 현장에서 시작합니다. 숲과 해안, 갯벌, 양식장에서 시료를 채집하고 미생물을 분리해 배양합니다.
메타바코딩과 메타유전체 분석으로 미생물 군집의 구성과 변화를 조사하고, 유전체·전사체·대사체 분석으로 기능과 상호작용을 확인합니다. 계통학과 집단유전학으로 분화와 확산 과정을 추적하며, 필요하면 이차대사산물 분석과 유전자 기능 검증을 수행합니다.
새로 확인한 생물은 분류학적으로 기재하고, 기존 분류군의 계통과 종 경계도 다시 검토합니다.